北捷環狀線行經新北市板橋區與新埔站交會處，但是民眾將無法在該站區直接進行轉乘。捷運局表示，捷運環狀線行經新北市板橋區為高架型式佈設，軌道路線由板橋往新莊方向，是由板橋文化路往北轉民生路，在民生路、文化路口是一個轉彎段，且軌道定線也需爬升從八里新店快速道路上方穿越，因此受限於工程定線以及捷運車站需設在直線段的要求，該路口無法設置環狀線新埔民生站，而需佈設於該路口以北的民生路直線段上，兩站位置相聚大約100公尺。
捷運局說明，雖然環狀線新埔民生站無法與板橋線新埔站作最直接的交會轉乘，需出站後再進站，但捷運局將就票證系統進行整合，出站後一定時間內再進站，目前規定是15分鐘，將不會重複扣基本里程票價，以維護旅客權益，同時未來針對兩車站間的旅客動線，該局表示將會與新北市政府交通局進行車站周邊的交通整合及改善。
另有關環狀線頭前庄站與新莊線頭前庄站轉乘問題，新莊線頭前庄站站體及1號出入口用地已配合環狀線頭前庄站工程，預留未來交會轉乘所需空間，未來環狀線通車營運後，兩站間可以在付費區內直接站內轉乘，無需出站再進站。