保護區內生態資源極度豐富，擁有多種魚貝類、蟹類、鳥類及植物，鳥類種類如黑面琵鷺、唐白鷺、黑嘴鷗、小燕鷗、魚鷹……等；植物方面雲林莞草及大安水蓑衣為臺灣特有種，更為保護區內重要珍貴稀有植物。
台中市高美野生動物保護區為避免遊客進入濕地嬉戲破壞生態於2012年6月22日公告實施分區管制。
今為避免遊客直接踩踏保護區核心區濕地，本府農業局擬於保護區解說半島前濕地施設一座解說及棲地棧道供民眾行走，該項工程將於即日起開始施作，為顧及工程施作時遊客人身安全保障，自即日起至工程完竣日止（預定為2013年3月31日）公告全面禁止遊客進入高美野生動物保護區內（包含永續利用區），現場將由在地巡護人員進行勸導工作，農業局籲請民眾造訪高美野生動物保護區時，遵守公告管制事項。
高美野生動物保護區這一塊藍色海岸的美麗瑰寶需要民眾與政府共同攜手維護。（攝影／羅惠文）
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