十二屆人大換屆會議，除人事調整外，外界稱為大部制改革的《國務院機構改革方案》最受矚目。昨人大十二屆一次會議的第三次全體會議，國務院祕書長兼國務委員馬凱做大部制方案報告。據馬凱表示，這次改革，重點在「實行鐵路政企分開，整合加強衛生和計畫生育、食品藥品、新聞出版和廣播電影電視、海洋、能源管理機構。」
照公布內容看，撤銷的七部委包括鐵道部、衛生部、人口計畫生育委員會、國務院食品安全委員會辦公室、廣電總局、新聞出版署及電力監管委員會；新成立「國家衛生和計畫生育委員會」、「國家食品藥品監督管理總局」、「國家新聞出版廣播電影電視總局」三機構。
大陸過去已進行六輪機構改革，去年十八大報告宣布「穩步推進大部門制改革」，今年二月底十八屆二中全會確認，改革方案提請本次會議審議。
十八大後「習李新政」備受矚目，百日內廿七名廳局級以上官員落馬，顯示「反貪」是新任總書記習近平執政重中之重。「大部制」做法，實際是為「反貪」打基礎。
如過去被嚴重詬病的鐵道部，一個坐式馬桶廿多萬元人民幣，一個紙巾盒一千多元，價值兩千六百萬的購票系統報價三．三億，更發生多次「買官」情事，顯示「鐵老大」貪腐之重。
李克強稍早亦強調，改革更重要的是職能轉換，讓政府歸政府，企業歸企業，「政企分開」；職能重組，如衛生及人口部門合併，強化食品藥品監管，減少毒奶粉、毒膠囊等民眾夢魘，強化「舌尖上的安全」；機構擴權，如因應釣魚台之爭，將相關單位納入海洋局。
大部制更是中央與地方關係的調整。馬凱說，大陸地域遼闊，國務院部門管太多太細，既管不了也管不好，大部制有利發揮地方積極性。為此，國務院做了幾項改變：下放投資審批事項，下放生產經營活動審批事項，將適合地方管理的專項轉移支付審批下放地方等。