李鴻源稍早在立法院說，能否將不在籍投票用在公民投票，「基本上應該是持保留態度」。
李鴻源接受記者訪問時表示，保留的意思不代表反對，而是從實務來說，他認為要給選務人員多點時間。
他說，內政部推動不在籍投票一直在審議階段，原本預計在2016年總統選舉推動；但選務複雜，包括選票怎麼印、如何開票與計票等，從沒討論到公投納入不在籍投票範圍。
李鴻源表示，即使現在立法院協商結果，認為這次核四公投要採不在籍投票，內政部草擬修法條文最快也要1個月，之後送行政院、立法院審查，立法院通過後，後續選務作業保守估計要半年，如果要在8月核四公投施行，實務操作非常困難，「幾乎是不可能」。
他說，立法院修法，最好狀況在這會期通過，最快也要到12月不在籍投票才有辦法上路，但大家都期待核四公投能趕快成行。
李鴻源表示，不在籍投票在國內從未施行過，應要給選務人員多點時間，「以執行面來看，做不到的事，不能貿然說好」，選舉制度改變牽涉層面相當廣，一定要非常審慎小心。