安倍發表的首相聲明說：「這對日本安全造成重大的威脅，同時也嚴重損及東北亞、國際社會的和平與安全，斷難容許。」
聲明指出，北韓這次核武試驗明顯違背日本與北韓之間達成的平壤宣言，也違反2005年9月6方會談協商的共同聲明。
安倍表示：「北韓違背透過對話解決問題的做法，日本表達嚴重抗議，堅決譴責。」
去年12月北韓以發射人造衛星為名試射長程火箭，今天又不顧國際警告，實施核武試驗，安倍指出，這是對聯合國安全理事會權威的重大挑戰，安理會應儘速協商處理。
安倍也強烈要求北韓即刻且完全履行安理會的決議。安理會曾通過決議，要求北韓停止飛彈和核武測試。
安倍並做出7點指示，包括蒐集情資並加以分析、提供人民正確的資訊、隨時因應不測、加強監測核武試驗所釋放出的輻射物質。
日本希望安理會採取因應措施，並將與美國、南韓、中國大陸、俄羅斯加強合作。日本原則上不同意旅日協助北韓官員活動的人士從北韓再入境，並將觀察北韓言行，再考慮進一步的因應措施。
日本政府發言人、內閣官房長官菅義偉今天在記者會上表示，日本政府將對北韓採取片面制裁措施，包括限制「在日本朝鮮人總連合會」（簡稱朝鮮總連）的副議長等5人入境。
日本也考慮進一步採取經濟制裁措施。