二代健保上路已2周，爭議卻還沒停，尤其衛生署日前「從善如流」宣布研究生兼職的補充保費下限比照大專生，調高至基本工資，引發民間監督健保聯盟等團體抨擊政策大轉彎，正凸顯補充保費的不公，設計一改再改，無法補洞、還越修越「落漆」，要求一視同仁，把失業者及兒少、老人的兼職下限比照學生辦理。
二代健保補充保費1月1日正式上路，另針對利息所得、股利所得以及兼職所得等6大項目，單筆收入只要超過5000元就要加收2%的補充保費。但新制未上路前就因為課徵下限門檻該訂多少？哪些人歸類弱勢免繳？而爭議不停。
民間監督健保聯盟和台灣勞工陣線、殘障聯盟今（14）天共同召開記者會，要求衛生署既要「從善如流」，就該將失業者與兒少、老人、身心障礙及學生等以眷屬身分納保者，一律納入經濟困難優免要件，兼職所得基本工資以下均免徵補充保費。
督保盟發言人滕西華表示，補充保費上路，一如預期引發各界討伐與批判，事實上，無論是督保盟或參與規畫二代健保的學者，甚至於前幾任健保局總經理都曾多次召開記者會警告政府，補充保費絕對是一個災難性的設計，將衍生更多結構性不公平問題及更多的行政浪費，更可能因收不到保費而危及健保的正常營運。
民間團體詬病，補充保費在各利益團體的壓力之下，衛生署一再「從善如流」的任意曲解健保法，先有補充保費下限從2000元提高到5000元；後有在銀行公會的壓力之下，利息所得就源扣繳門檻提高至20000元；以及18歲以下兒少、大學生等兼職所得補充保費下限提高至基本工資等。
最近一起政策轉彎，滕西華說，衛生署又在研究生及部分立委的質疑之下，再度擴權解釋，自打嘴巴推翻了衛生署長邱文達「研究生已是成年人，應參與這項互助自助的制度」的見解。
督保盟強調，由於補充保費設計的缺陷，類似不公平的爭議將層出不窮，也凸顯其荒謬性，難道失業勞工、沒有所得的家庭照顧者，以及背負高額學貸壓力的青年勞工，就不算弱族群勢嗎？
民間團體呼籲，健保局即將召開的新制健保健保會，必須要將最近補充保費所衍生的種種亂象列入議程，並檢討衛生署違法曲解母法的責任；且政府應將失業者與兒少、老人、身心障礙或是學生等無業者，一律納入經濟困難優免要件，兼職所得基本工資以下均免徵補充保費，並回溯至1月1日實施。