人事總處表示，勞保局配合行政院組織改造，規劃由事業機構改制為行政機關，為使組織改造工作順利推行，依公營事業機構改制行政機關現職人員待遇及退撫處理原則，辦理改制後人員待遇及退撫事宜。
人事總處說，勞保局具公務人員任用資格的現職人員，現行依用人費率事業機構待遇月支新台幣3萬3587元至13萬5904元，改制為行政機關並依規定辦理改任換敘後，依公務人員待遇月支2萬9345元至11萬6245元，待遇約減少4000元至2萬元。
人事總處指出，對於待遇的減損，現職人員得選擇補足待遇差額，其差額並隨同全國軍公教員工待遇的調整、職務調動（升）、考績晉級、升等增加的俸給數額而併銷，且支領差額期間不得請領婚、喪、生育及子女教育補助費等生活津貼；或可選擇不補足待遇差額，並依規定請領生活津貼方式辦理。
人事總處說，改制後勞保局人員獎金由現行最高4個月績效獎金，改為合計最高2.5個月考績獎金及年終工作獎金。
人事總處指出，改任換敘人員需選擇自行購買退休年資，包含一般行政機關公務人員退撫基金應自行負擔提撥的35%、由政府負擔提撥的65%及相關孳息後，才具有與其他行政機關公務人員一致的退休給與，並無媒體所稱自肥情事。