同時，由於南電去年的嚴重虧損，至少讓持有南電66.97%股權的南亞(1303-TW)認列10億元以上的轉投資虧損。
南電在2012年第3季財報稅後虧損達到4.38億元，每股稅後虧損達0.65元；2012年1-3季稅後虧損7.65億元，每股稅後虧損達1.18元，而在第4季的營收下滑影響之下，無力為全年獲利加分，更跟隨單季重大虧損，也形成南電2012年除第1季之外，全年連虧3季的窘況，全年虧損近20億元。
同時，對於南電去年全年虧損的狀況，南電主管表示，將在3月底全年財報出爐以後，正式對於提出說明，同時，南電股東會訂6月間召開。
南電股價在去年11月21日盤中以31.5元創2006年4月7日掛牌以來新低價，南電股價在上市掛牌當月最高達373元。