由於原住民團體曾抱怨五都升格後，已有五個原住民鄉喪失自治權，憂心桃園縣升格後復興鄉也會消失。陳揆昨指示桃園縣升格後，應注意保障轄區內原住民族權益。對於桃園縣政府已規劃設立原住民族專責機關扶植經濟事業發展，原住民族地區區公所組織及權限，也規劃藉由事權下放或委託辦理方式，將與當地原住民族切身相關的業務，授權區公所辦理，陳揆也要求內政部及原民會等相關部會協助桃園縣政府落實執行。
陳揆並指示，有關中央與地方政府間組織的配合、擴大授權或財源分配等問題，要求內政部邀集相關部會討論桃園升格後遇到的瓶頸與法規修改等問題；桃園縣升格所涉及組織調整、法規整備、財政、預算、人員權益保障等事宜，也要求內政部等相關部會參照五都改制直轄市相關處理原則，協助桃園縣府做好改制準備工作。
自一百年一月起準用直轄市相關規定的桃園縣，是在去年七月底申請改制升格，內政部審查小組認定其已具備法定人口要件，且桃園位處國門之都，創稅能力僅次台北市，各項基礎條件優異，已達直轄市條件，並已規劃機場捷運路網、積極推動桃園航空城計畫，預期可大幅帶動周邊區域發展及經濟效益，因此同意其升格。