為使各區活動中心之設置、使用及管理一致及法制化，市府依據「臺南市市有財產管理自治條例」訂定「臺南市里社區活動中心設置使用管理辦法」，並訂於12月25日正式施行。市府民政局表示，區公所雖為管理機關，但區公所可指定里長、社區理事長擔任活動中心管理人，負責實際管理及維護工作，與原先由里長及社區理事長管理模式沒有改變，里民及社區居民對活動中心使用權益並無影響。
為讓新訂管理辦法無縫接軌，市府民政局已訂定「臺南市里社區活動中心設置使用管理辦法執行期程計畫」，各區公所並依計畫期程積極完成各工作項目，辦理說明會、確立各活動中心管理員、規劃各活動中心預算、積極完成管理工作交接並將專戶盈餘繳庫等行政作業。
部分里長、社區理事長擔憂「臺南市里社區活動中心設置使用管理辦法」，施行後，管理權喪失，過去累積的盈餘全部收入納入市庫，地方長年辛苦就白費。
對此，民政局表示，活動中心所收取之費用，雖全數繳入市庫，但其相關收入、支出由區公所編列預算辦理，規費收入扣除相關活動中心費用後百分之百回編預算給里、社區使用。本管理辦法施行後除可解決里長、理事長長年來自行支付水電費困擾外，亦可防止因地方派系造成活動中心使用上之衝突。
民政局說，各里社區活動中心過去收取費用之「盈餘」繳入市庫後，區公所分年度回編預算給各里社區活動中心支用，市府民政局將統一訂定「臺南市里社區活動中心經費支用要點」，只要符合規定並有利於活動中心管理、活化，促進地方建設及和諧發展等用途皆可支用，以利活動中心多元使用。