阿里山森林鐵路具備聯合國教科文組織登山鐵道世界遺產中「一百八十度大轉彎」、「廻圈形路線」、「之字形折返路線」、「特殊設計火車」以及「齒軌式鋼軌」等珍貴五大工法普世價值的中的前四種，與已列入世界遺產的五大登山鐵路共駕齊驅。
2009年莫拉克風災重創南台灣，嘉義縣阿里山地區尤為嚴重，阿里山森林鐵路421處路基流失、隧道損壞及邊坡滑動，全線中斷，使國際觀光景點阿里山受到嚴重影響。行政院重建會推動「再造大阿里山風華計畫」，包括阿里山森林鐵路的修復，番路鄉台18線五虎寮溪轆仔腳區迎賓大道，並提昇阿里山森林遊樂區環境整體改善，讓觀光客到訪後感受對鄒族達邦、里佳部落之自然農法、無毒產業及農特產品包裝行銷新風貌，期使阿里山與日月潭兩大國際知名景點串連等為目標，最重要的還是期待民眾多前往及獲得社會各界更多的支持，讓台灣永續觀光產業能夠繼續發展。
行政院重建會表示，阿里山森林鐵路目前復建工程施工相當順利，祝山線、神木線已於99年6月19日復駛；嘉義至奮起湖已完成復建，預計102年5月復駛；奮起湖至阿里山段施工中，目標103年7月全線復駛。在林務局努力下，深信不久將來森林小火車將奔馳在世界人們的眼前。