最具爭議的就是陸軍司令部通信電子資訊處長羅賢哲少將，他一路表現優異，深獲長官信任，卻早遭中國所吸收，成為解嚴後最高層級的共諜，因此被判無期徒刑定讞。
藉職務之便貪小便宜的也不少。空軍司令雷玉其上將竟大陣仗動用近五十位官兵擔任兒子婚禮的工作人員，還編有「婚禮任務編組計畫書」，比打仗還認真，事件曝光後，隨即遭撤換。
軍情局長葛廣明中將私自挪用公款而遭判刑，也被彈劾；軍備局生產製造中心主任陳治安少將便宜行事，直接指示部屬竄改公文，遭勒令退伍，還被公懲會懲處。皆因小失大而致晚節不保。
男女關係也是將官的重大考驗。國安局駐巴拿馬工作站長楊建平少將，因涉入僑商間的三角桃色糾紛，除遭記過、調職外，還被監察院彈劾；六軍團參謀長陳昇少將則遭控性騷擾，而被記過、調職，遂報請退伍。
未依法、按規而引發爭議的更是常見。前國防部長陳肇敏上將在空軍作戰司令部司令任內，縱容空軍反情報隊違法辦案，枉殺江國慶，讓國防部在社會壓力下，痛斥老長官「人神共憤」。
更可議的是，領取高額退休俸的前國防大學校長夏瀛洲上將，似乎早忘了共軍是國軍唯一敵人，還多次赴中與共軍把酒言歡，甚至接連說出「國軍共軍都是中國軍」、「國軍共軍都是為了中華民族的統一」等不當話語，引爆台灣社會公憤。