針對本案，教育部前曾於101年10月30日發布新聞稿說明將儘速朝修正「香港澳門居民來臺就學辦法」，取消學校同意函辦理加簽作業並放寬港澳學生於簽證效期內可多次入出境等規定辦理；惟於相關辦法未完成修訂發布前，為確保港澳學生遇緊急事故能即時順利出境，教育部並於今年11月6日通函全國各公私立大專校院，請學校就學生申請出境與請假分開處理，簡化出境申請程序及建置緊急事故處理窗口（含非辦公期間），復於今年12月4日函送164所大學校院辦理港澳學生出入國緊急事故處理窗口彙整資料予內政部入出國及移民署，以利該署協助遇前項緊急事故之港澳學生順利出境。
目前教育部已研擬香港澳門居民來臺就學辦法修正條文，將儘速邀集陸委會、僑委會、移民署等相關部會及學校代表開會研商，兼顧所有境外學生相關權益之衡平性，並配合其他政策及配套措施檢討修正，以求周延。
港澳學生倘對本修正案有任何意見，可透過後續法案預告程序表達修法建議，全案並將俟報行政院核定同意後，循行政程序發布，預期於明（102﹞年7月底前完成修正發布。