九十九年十一月十一日，扁因龍潭購地案、買官案，為最高法院判刑十七年六月定讞，前年底發監服刑。他所涉相關案件，去年陸續宣判，但教唆幕僚偽證、國務機要費等案都在高院更審中。
扁被判刑確定部分，高院上月宣告應執行有期徒刑十八年六月；至於吳淑珍部分，她涉龍潭購地收賄及洗錢案、陳敏薰買官案，及另確定的南港展覽館圖利案、為國務費案教唆偽證案、處理陳敏薰賄款洗錢案，六案被裁定應執行十九年二月徒刑，併科罰金一億五千八百萬元，比阿扁三案的執行期多了八個月，
由於扁珍目前剩餘還在審理中各案，犯罪時間都在九十四年二月二日刑法五十一條修正案公布前，依舊刑法五十一條規定，宣告多數有期徒刑案件，合併執行後，最長就是執行廿年；昨天最高法院就金改弊案，判扁十年、珍八年定讞，使得二人判刑確定的刑期，已超過舊法有期徒刑廿年的上限。
換言之，扁珍涉及的所有案件，不論判決刑度輕重，合併執行上限就是廿年。除非扁珍被加重改判無期徒刑，否則還在審理中教唆偽證、國務費、金改案洗錢、收受國泰金三億元、隱匿機密公文等案，對扁珍的最重刑期不會再有累加的影響。
由於扁案偵審期間，扁曾被羈押七百卅四天，依法可抵兩年多的刑期，以上限廿年計算，扣除目前已服刑一年七個多月，未來扁再服刑約六年多，即民國一○八年，刑期就可能過半，達到可報請假釋的標準。
另外，扁案中南港展覽館工程弊案，前內政部長余政憲二審被依圖利、洩密罪，判刑二年六月，褫奪公權四年；余政憲友人洪重信判一年十月，褫奪公權三年，緩刑四年。最高法院認為，二審沒有釐清余、洪與吳淑珍是基於何種不法利益而洩密，將判決撤銷發回更審。