儘管民進黨內的政治派系眾多，包括新潮流系、蘇系、謝系、游系等均在黨內佔據重要的位置和影響力，但從兩岸政策思維之角度來觀察，民進黨內部的大陸政策其實只有兩個陣營：保守派陣營和務實派陣營。
保守派主要是以民進黨和綠營的基本教義派為主體，他們主張民進黨應該最終建立起臺灣共和國，完全徹底與中國大陸進行切割。而這種切割不但是內容要切割，形式上也要進行切割。也就是要與中國大陸徹底劃清界線。如同李登輝所言，臺灣與中國，你是你，我是我，我們之間沒有任何的關係。保守派在黨內儘管人數較少，但他們的聲音很大。務實派則主張可以接受中華民國，接受臺灣的憲法體制，主張民進黨的大陸政策應該務實，不應以意識形態劃線。務實派儘管支持者眾多，但由於對黨內話語權的掌握嚴重不足，在民進黨整個大環境相當保守的背景下，人數眾多的務實派常常被人數極少的保守派所攻擊所打壓，從而陷入令人費解的被動狀態。
當然，無論是保守派還是務實派，他們的大陸政策思維雖然有很大的差異，但也有相似之處。從相同點來觀察，保守派是主張赤裸裸的公開的台獨，而務實派則可劃分為隱性台獨，或者說是借殼上市，為台獨披上中華民國的外衣。這是其共性的一面。從不同點來觀察，保守派與務實派在大陸政策方面的主要分歧點當然有很多，但主要的一個區別還是在是否與中國大陸切割上。保守派主張要與中國大陸完全切割，不留一點痕跡，切割得越徹底越好。而務實派則是主張與大陸可以切割，但這種切割應是不完全的切割，要與大陸保持一定的聯繫。從某種程度上可以這樣認為，保守派的主張仍然完全是從理念與意識形態的角度來考量兩岸關係，他們排斥利益的觀點。而務實派的主張則是從現實利益的角度來考量兩岸關係，他們基於兩岸互動的現實需要、民進黨的選舉需求等現實利益出發來對待兩岸關係。
隨著民進黨連續在2008年及2012年兩次大選中遭到重大失敗，民進黨內部保守派的聲勢有所下降，而務實派的聲勢有所抬頭。由於保守派與務實派的鬥爭直接涉及到對民進黨兩岸政策路線的影響力與主導力，所以其鬥爭相當激烈。儘管目前務實派尚未取得絕對性的勝利，但黨內政治生態發展趨勢似乎越來越朝著有利於務實派的方向發展。特別是隨著民進黨重量級政治人物謝長廷訪問大陸之後，民進黨內部務實派的信心有所增強，務實派積極突破保守派意識形態禁錮的動作不斷增強，這對於未來民進黨內部政治生態發展以及大陸政策思維調整都或將產生重要的影響。