對於營運權利金偏低，議員要求落實查核業者有無涉及關係人交易，北市交通局長林志盈表示會徹底追查，法務局局長蔡立文則坦言如仲裁輸了，錢可能要不回來。
統一：依合約進行 沒有不繳租金
統一開發總經理室經理張再春則回應，這是爭議事件，統一從來沒有不繳租金，一切依合約進行，接下來就待仲裁結果出來再決定。
對於案件進入仲裁，北市議員李慶元高分貝抨擊市府圖利財團，非屬爭議性的案子怎麼可以仲裁處理？「統一集團擁有市府轉運站五十年經營權，五十年市府共需支付市府轉運站房屋稅、地價稅共二十二億五千萬元，最後都由全民幫統一買單。」他說，如果明年仲裁結果出爐，統一積欠的租金討不回來，失職官員統統下台。
李慶元指出，這樁ＢＯＴ案，依合約規定統一集團需繳交市庫二十五億開發權利金、九十四至九十八年市府轉運站開發期間仍需依地價稅打八五折、合計應繳一億六千萬元租金，及營運開始公告地價三％的租金約八千多萬元與營運權利金的○．五％。但交通局預算書預估市府轉運站今年稅後純益僅五千六百四十萬元，讓李慶元大呼「不可能」，「市府抽○．五％營運權利金，等於僅收取二十八萬元。」質疑統一低報營收狀況，要求交通局查辦有無涉及關係人交易，將租金提高租給子公司，降低稅後純益。
議員楊實秋建議交通局應私下調查商圈鄰近百貨的稅後純益，才知道統一有無謊報財務，議員徐佳青也大動肝火指稱，交通局從租金、營收都聽統一的，「市府從房東變成細漢ㄟ」。
北市公運處處長王聲威表示，一切需待財報出來才能得知統一有無低報盈餘，如與事實不符該補的權利金還是要補。
議員陳彥伯認為統一不繳交租金，就不把市府轉運站租借給他，根本不需要仲裁協調，直接打官司就好了，議員秦儷舫也說，市府該多管齊下叫統一還錢，要求以後由研考會帶隊，環保局、消防局、衛生局、建管處、勞工局等局處每個月到市府轉運站做公安檢查，不信討不回這筆債。
九十三年市府將市府轉運站委由統一集團經營，因北市稅捐處誤核地價稅為零，前年雖已發現誤核並展開追討，但統一集團認為依照ＢＯＴ時簽下的合約不需繳稅，十月中旬進行仲裁程序。