霄裡溪上游華映、友達兩事業放流水排放，多年來造成水質污染疑慮。行政院環境保護署說明，環保署177次環評大會決議，以放流水改排老街溪為較佳方案，並請桃園縣政府核發排放許可。桃園縣政府在今年2月沒有附改排條件就直接違法展延友達公司排放許可證效期，環保署3月去函撤銷。
環保署於民國97年考量部分沿岸民眾擔心井水受上游工廠放流水影響，協調新竹縣政府辦理霄裡溪沿岸居民以水車供水替代井水事宜，持續至98年12月21日止。
此外，環保署持續進行霄裡溪沿岸民井水質檢測，至今抽驗霄裡溪沿岸民井共30批次，其中兩處民井的鉬金屬曾偏高，目前已無偏高情形。
為因應民眾擔心井水「鉬」的變化，環保署在去年4月請新竹縣政府及自來水公司提報補助專案至環保署，將該兩處民井受影響24戶接裝自來水；目前除不願接裝2戶外，其餘都接裝完畢，追蹤水質無異常。
環保署說，已協調自來水公司辦理自來水管線鋪設，由經濟部水利署將「霄裡溪部分民井居民接裝自來水計畫」優先納入「無自來水地區延管工程補助計畫」。
為確保未來霄裡溪符合水體用途甲類水質目標，環保署協調友達和華映提出水質優化方案。友達提出放流水朝「全回收、無製程廢水排放」排放許可變更申請，環保署另將督促華映比照辦理，盼早日消弭桃竹兩縣因工業放流水所引發的紛爭。1