但國家實驗動物中心申請引進大陸基因改造鼠的過程歷經波折。該中心副研究員秦咸靜指出，ＥＣＦＡ早收清單開放大陸進口貨品中，沒有實驗動物的分類，經濟部可能基於防疫考量，把實驗動物跟犬貓同列禁止進口項目。經國科會協助溝通半年後，以專案申請進口，有效期僅一年，明年屆滿，須重新專案申請。
南京大學模式動物研究所主任高翔表示，大陸對引進台灣基因改造鼠沒有任何限制、也沒有必要限制，希望兩岸合作「做更大一點」，即使要競爭，也是跟歐美競爭。大陸兩年前就透過學術合作，從台灣引進老化基因改造鼠。
秦咸靜分析，國際生醫研究約有七十五％使用老鼠當實驗動物，其中一半實驗跟基因改造鼠有關，主要就是利用基因剔除或基因轉殖模擬人類疾病，研發新療法及篩選新藥。美國銷售排名百大藥品中，三十四％是利用基因改造鼠開發出來。
國家實驗動物中心突破ＥＣＦＡ框架，與南京大學簽署合作意向書，完成跟廿二個國際級種原資料庫銜接任務，目前擁有來自全球逾二萬三千種基因改造鼠及廿萬種以上基因改造小鼠胚胎細胞，可供國內選擇適合試驗鼠研究。