出席預備會議的我方代表團長為台北駐日代表處業務組長張仁久，外交部、漁業署和海巡署相關人員以觀察員身分出席；日方團長為交流協會總務部長小松道彥，外務省、水產廳、海上保安廳及內閣府沖繩總合事務局的各相關官員也以觀察員身分出席。
預備會議首先由雙方團長「各自表述」，提出我國對釣魚台的一貫立場為「主權在我、擱置爭議、和平互惠、共同開發」，並且重申釣魚台為我國固有領土，是台灣的附屬島嶼，附近水域為台灣漁民長久以來的傳統漁場，我漁民在該水域的正當捕魚權利必須獲得充分保障，在此同時，為增進台日友好關係、區域和平穩定繁榮及永續發展，使東海成為「和平與合作之海」。
日本政府對釣魚台的基本立場是「與其他外國沒有任何領土上的紛爭」，這一點在會議也被提及。
水域範圍、捕魚規則 皆無共識
據悉，我方提出的要求水域是在二十七度以南的第一批專屬經濟海域暫定執法線以西的範圍，此一範圍涵蓋釣魚台諸島在內，日方仍然以台日中間線為基準，雙方沒有任何交集。
據稱，日方最堅持的是，要求我方提出一套「捕魚規則」來，並且要求嚴格有效管控，以免破壞漁場生態，始能繼續下一次的談判。
據透露，國際上對近海捕魚的魚網大小都有一定的規格，台灣漁民大都以合格的魚網提供檢查，出海後以捕蝦的流刺網捕魚，大小通吃，造成漁場枯竭，針對這一點，日本水產廳有強硬態度，除非台灣有維護漁場秩序的決心，否則下一次的預備會議也很難繼續下去。
外交部長林永樂稍早表示，對外交部來說，保護主權、維護漁權是並行目標，若雙方還有需要舉行第二次預備會議，因日本將於十二月舉行大選，時間點可能在明年上半年或春天。
針對台日雙方都由技術主管官員代表參加，缺乏決策官員與會，林永樂表示，協商不是只有一個管道，台日之間高層向來有會外協商，一直都有在溝通。
這次會議定位是技術性協商，由雙方實際主管業務官員出席，雙方層級對等，也都希望能有實際進展；雙方同時有這樣的政治意願，這是正面訊息。