兩岸簽署經濟合作架構協議（ECFA）早收清單後，台灣現仍有約830項農產品未開放大陸進口。
中國大陸商務部部長陳德銘日前呼籲台灣應比照世貿組織其他成員待遇，平等開放更多大陸農產品進口。中國國民黨籍立委李慶華與黃昭順、民主進步黨籍立委林岱樺、陳明文與黃偉哲等人今天質詢時皆關切，憂心衝擊台灣農業。
陳保基今天多次重申，與陸方談判一定會考慮對台灣農業衝擊及農民利益為優先。
對大陸希望台灣開放更多大陸農產品進口，陳保基說，我方原則是國內沒有生產、目前是大量進口農產品，未來談判可以考慮，例如蘋果。
陳明文質疑，長期以來在任何一個談判，農業都是被犧牲。
陳保基不認同其看法並指出，這是傳統農業概念。
陳保基強調，台灣農業有非常好的發展條件，但當我方開放零關稅進口時，其他國家同樣也對台灣開放，為什麼每次一談到貿易自由化時就「縮」起來。
他認為，台灣應用更積極態度去拓展、加入自由貿易市場，而不是一直躺著被挨打；他呼籲應拋棄以耕作和產品為主的概念，擴大農業價值鏈，發展精緻農業，像是發展高級農產品加工，提高產值。
陳保基呼籲農民放心，政府不會做讓他們感到威脅的動作，但他強調農民一定要改變，改變一定會有些干擾，就像一盆水經攪動會注入許多氧氣，但可能孕育出新的東西。