全國教師工會總聯合會指出，教育部高教司的師培院校轉型經費只限師培大學申請，師範學校的公費制原就對招生有利，而參與計畫的台中教育大學公費生從30名申請增到60名，如果所有師培大學都參與計畫，可能排擠一般大學師培生的就業機會，也讓師培走回一元化。
教育部中等教育司長張明文表示，培養優質和多元師資是教育部的政策，因此會全面照顧所有的師培相關學校，高教司的師培轉型經費只是方案之一，教育部也已規劃針對一般大學師培中心的相關補助案。
張明文表示，雖然現在公費制度仍限定師培大學，但這些公費名額都是學校自行和地方政府爭取的，而現在每年公費生只有約100多位，教師甄試卻有3000多個名額，公費名額也不可能無限制擴張，因此不至於排擠一般大學師培生。