馬總統11月2日接受亞洲週刊專訪，相關內容今天刊出。被問到安排前國民黨秘書長金溥聰擔任駐美大使的考量為何，總統說，這4年來和美方的關係愈來愈穩定與友好，前駐美大使袁健生一直很希望交棒，因此幾經考量後，調回國內擔任國家安全會議秘書長一職。
他說，國安體系包括外交、國防及兩岸等層面，這次國防未有太大變動，其它之所以變動，也是預期過了4年，會有不同的挑戰，因此做這樣的安排，除希望與美國持續發展，並再針對兩岸政策提出一些新的內容。
「當然與美國之間仍有一份很長的清單，包括經貿及其它各領域，其實還有太多的事情可以做」，馬總統說，他上任之前，因為台灣與美國關係不好，很多事情都沒有做，現在都慢慢動起來，美方也願意配合，例如這次免簽計畫，美方派商務部次長桑傑士前來，這相當罕見，代表美方很願意與台灣改善實質關係。
提到與美國的關係，馬總統說，真正重要的是，一個大的政策框架是否合乎美國利益。台灣如果不斷與中國大陸發生衝突，甚至於有其它更嚴重的狀況，對美國當然不利。
總統說，目前與大陸的關係是60年來最好，與日本的關係也是40年來最好，與美國的關係則是斷交30多年來最好，美國不會想要改變目前情況，這點大家都非常清楚。他上任後，美方共3次同意軍售，美國兩任不同總統均採一致立場。
週刊記者問到馬總統認為中華民國與日本的關係目前是最好的，但雙方卻打了水砲大戰（指台日船艦日前在釣魚台海域對峙）？總統說，噴水那是小場面。他認為大家最後還是要回到談判桌，坐下來仔細想怎麼解決這個問題。