馬總統11月2日接受亞洲週刊專訪，相關內容今天刊出。在談到中共18大議題時，他指出，從大趨勢來看，兩岸關係的和平發展，對雙方與東亞甚至世界、美國都有利，「因此我看不出即使換了領導班底，在大致的方針上有什麼差別」。
總統說，對未來3年多任期要推動的兩岸政策，簡單地說包括擴大並深化兩岸交流、兩岸兩會互設辦事機構，及全面檢討修正兩岸人民關係條例。這3項工作如能做好，兩岸關係毫無疑問又會向前邁一大步，「據我瞭解，大陸方面對這3項工作也都相當支持」。
談到是否考慮在任內到中國大陸訪問，總統表示，這個問題最主要的困難，在於雙方應該互不承認主權，互不否認治權。雙方都主張「一個中國」，「我們的『一個中國』是中華民國」，也涵蓋了台灣與大陸。
總統說，以中國國民黨黨主席身分訪陸的可能性很低，台灣民眾也絕不可能接受，因為無論到哪裡，「我都是中華民國總統」，不能因為要到中國大陸而改變身分，民眾也會覺得這是一種矮化。
至於是否考慮邀請即將接班的大陸國家副主席習近平或其他中共領導人到台灣訪問？總統表示，以長期來看也許不能排除，但目前時機還不成熟，像台灣的部會首長要到大陸訪問，對岸媒體絕對不會稱為部長或主委；但他們來台灣訪問，台灣媒體都會稱他為部長，這是因為雙方媒體生態不同。
他認為，在這種情況下，一定要雙方在這種看起來是小事，但背後是重要理念的問題做適當的解決才可能，否則雙方很難在這個基礎上互動。現在台灣也有部會首長到大陸參加會議或各類體育比賽，但很少在公開場合以其頭銜相稱，「這看起來是小事，但其實很重要」。