衛生局解釋，過去集點項目瑣碎，不夠系統化，民眾必須洽詢工作人員要集點，影響集點意願；而明年三月發行的台北市民卡功能更多，最大特色是可折抵現金，以二代晶片悠遊卡結合兒童醫療補助證及市民健康卡，後續如社會局的老人卡也可能逐步納入，集點點數即為小額現金，可直接扣抵聯醫醫療費、捷運、公車費用，藉此提高集點意願。
台北市議員潘懷宗表示，市民健康卡為北市府重要政策之一，適用對象為北市市民與其新移民配偶，衛生局印製五十三萬多張，為了衝發卡量，不斷發給民眾，但民眾根本不知道用途，造成高空卡率，截至今年九月底，持有市民健康卡但未累計點數的共十一萬三千多人，佔總持卡人數廿四．三％，還有六萬多張卡等待民眾申請。
潘懷宗質疑，市民健康卡對年輕族群吸引力不足，集點項目偏重中、老年人的需求，例如三高篩檢、五大癌症篩檢，多數民眾最想獲得高階健檢，但年輕族群累積不易，集點意願自然低落。
台北市議員王鴻薇批評，衛生局明年花一千八百萬發行十三萬張市民卡，光是租借五百台讀卡機就花費六十萬元，每一台讀卡機租金高達一千兩百元，市售讀卡機一台不過兩百卅元至五百元，衛生局租的比買的還貴上二至五倍，難道北市是散財童子？
衛生局簡技游麗惠解釋，市民健康卡就是一張普通的集點卡，但市民卡未來目標是將民眾的健康資訊上傳至雲端，讀取市民卡就能知道自身健康資訊。市民卡擁有晶片功能，製卡成本自然不同。另外，市民卡累積點數可折抵現金，所使用讀卡機與一般讀卡機不同，租金自然較貴。
游麗惠也說，集點項目未來將逐年調整，例如明年新增孕婦接受衛生主管機關提供的六次免費產檢，即可集點，照顧不同族群的需求。