金墩米自行送驗發現農藥超標，自行下架回收，結果竟然是烏龍一場？金墩公司在2日先是澄清表示，對於金墩米農藥檢驗過量是口誤。後來在外界不斷追問下，3日又改口，實際上是因為看錯了檢驗報告，換句話說，金墩米有毒根本就是烏龍一場？農糧署對於金墩公司反覆不清的說法表示：不可思議。
金墩米爆出含有農藥的事件之後，不僅人心惶惶，更重要的是要趕緊查出到底是哪一個環節出了錯誤，農委會農糧署在成立專案小組的調查過程當中，發現金墩公司不僅對於所含農藥到底是什麼？說不出個所以然，甚至於要看檢驗報告，業者也無法提出，讓人丈二金剛摸不著腦袋。
可笑的是，3日金墩公司總經理沈永成出面澄清，一切都是烏龍一場，是看錯了檢驗報告。在10月9日抽檢稻殼中有2件被驗出農藥殘留，後來在經過兩次複檢確認沒有問題，但是主管卻只看到有問題的部份便往上呈報，讓公司決定自行將產品進行下架。被點名疑似有農藥殘留的稻米源頭是花壇鄉的農民，氣得大罵冤枉。
農糧署對於金墩公司的說法直斥不可思議，但還是表示，現在不能只憑金墩公司的說法就算數，將繼續把問題釐清再來確認後續的因應措施，包括產品是不是全面下架，甚或者吊銷其糧商執照。