這項活動舉辦主軸特別強調分工合作、擴大參與。主辦單位奇美醫學中心除負責規劃整體活動內容，讓會議順利進行外，也邀請美國、日本、韓國、大陸及台灣等神經外科界重量級教授特別出席演講，邀請40位外賓進行專題演講，此次發表論文共350多篇。
全球華人在神經外科領域成就非凡，其中台灣神經外科杜永光教授甫當選世界神經外科聯盟理事長，締造了台灣學術界之光。為了讓全世界華人從事神經外科及相關領域專家有一學術交流的平台，2004年首屆世界華人神經外科醫學會在海南島博鰲舉行，計有世界各地華人神經外科醫師約500人參加。
2006年第二屆學術大會由重慶市舉辦。2008年於廣東東莞舉辦第三屆大會。2010在四川省成都舉辦第四屆大會，參加人數已有2,000人。在第四屆大會中，當時的邱仲慶院長代表奇美醫學中心以超過一半以上絕大多數選票當選第五屆大會承辦單位，這是台灣第一次由奇美醫學中心承辦世界華人的神經外科學術大會。
2012年奇美醫學中心於台南市舉辦此次大會國外有500位神經外科醫師及國內500位神經外科醫師參加。討論內容包括腦瘤、腦血管疾病、神經功能性手術、腦創傷、小兒神經外科、脊椎手術與基礎研究等。奇美醫學中心也將該院電腦刀( Cyberknife )的治療和腦創傷的跨團隊(神經外科、復健科、高壓氧科、中醫部及精神科等)治療經驗提會報告並與各國專家研究分享。
本次大會眷屬及參展廠商約有1,500人左右。國外參加者預估會有800人左右。以每人平均停留在台七天，每天平均消費5,000元新台幣，將為台灣相關產業帶來約3,000萬的觀光收益。在全球經濟普遍不景氣中，奇美醫學中心舉辦此項大型國際會議，間接刺激國內及台南在地經濟活動，亦為會議增添另一層意義。
本次大會主席也是奇美醫學中心院長邱仲慶表示：秉持『深耕在地人文醫療，創造奇美優質明天，引領走向國際世界』的理念，奇美醫學中心主辦第五屆2012年世界華人神經外科年會在台南舉行，全體員工都欣喜期待、歡欣迎接，全力讓大會順利、圓滿成功。