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台灣超級細菌密碼破解成果發表會

中央社/ 2012.10.30 00:00
台灣超級細菌密碼破解成果發表會

(中央社訊息服務20121030 18:32:59)為了要了解細菌抗藥的原因,進而能找到治療的方法,台灣AB團隊於2009年由靜宜大學唐傳義校長召集成立,歷經3年成功將不動桿菌中的一個流行菌株TYTH-1解碼,今(30)日上午在台大醫院新竹分院舉行台灣超級細菌密碼破解成果發表會,由台大醫院新竹分院內科感染科主任郭漢岳、元培科技大學醫事科技學院醫學檢驗生物技術系劉明麗教授、靜宜大學唐傳義校長共同主持說明。

郭漢岳主任說,當時與林明鋒醫師結合感染控制小組與檢驗科細菌組團隊成員從2005 年開始收集菌株,從臨床資料的收集到細菌身分的鑑定,建立了整套細菌分析的流程。

為了要更進一步分析細菌的特性,在當時仍然是台大醫院的前身-行政院衛生署新竹醫院時代,資源非常有限的情況下,郭醫師團隊成員於2007年結合了元培科技大學劉明麗教授的團隊來做更進一步的菌源分析。

元培科技大學劉教授的實驗室裡,劉教授帶領著學生不斷的從菌株的抗藥表現型與抗藥基因型去尋求細菌抗藥的真實原因,所有的研究成果自2009年開始發表在美、日、英等國際性抗藥領域的期刊上,特別是2009年的細菌抗藥領域研究成果更是獲得國際研討會論文大獎。由於細菌的抗藥過程非常的複雜,2009年劉教授請求靜宜大學唐傳義校長的協助,期望藉由生物資訊團隊的協助來解答細菌抗藥的機制。

劉明麗教授表示,為了要解開AB的全基因體,2009年開始,台灣AB團隊由靜宜大學唐傳義校長召集成立。由靜宜大學唐傳義校長所率領的靜宜、清華生物資訊分析團隊聯合台大醫院新竹分院郭漢岳醫師團隊、元培科技大學醫學檢驗生物技術系劉明麗教授團隊、與慈濟大學醫技系張凱誌教授、台灣動物科技研究所楊程堯研究員、中華大學生物資訊系劉志俊教授團隊由唐校長率領的靜宜大學與清華大學生物資訊團隊領軍。

唐校長的博士班學生謝明峰、呂嘉維、李季青與張君天輪番交棒進行組序與排序的工作,依次交棒給元培科技大學醫學檢驗生物技術系劉明麗教授所帶領的微生物診斷暨醫學分析實驗室團隊、慈濟大學醫技系張凱誌教授、台灣動物科技研究所楊程堯研究員與台大醫院新竹分院郭漢岳醫師團隊進行序列驗證工作,最後交棒給中華大學劉志俊教授進行基因密碼註解與上傳送至美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心(The National Center for Biotechnology Information簡稱NCBI)。成為全國第一個以學校實驗室而非國家級實驗室完成細菌體解碼。

此種大突破,將作為包氏不動桿菌基本資料,可用來找出多重抗藥性菌株的抗藥性關鍵位置,以解決當前存在的多重抗藥菌株臨床治療與散布的問題有相當大的幫助。

劉教授表示,去年成功的7株台灣本土菌株解序,命名為TYTH1至TYTH7,TYTH的第一個T代表台灣、Y代表元培、第二個T代表清華、H代表台大新竹分院的前身署立新竹醫院。其實此種研究都是以國家級實驗室所做研究完成,而以靜宜、清華與中華的生物資訊分析團隊與元培科技大學簡易實驗室能夠完成此種研究,真的是很不容易。

由於所有的團隊成員緊密的合作與無私的奉獻造就全基因體密碼成功上傳。這條AB基因體為全世界的第11 條,亞洲地區的第5條。目前亞洲有4條分別為台灣衛生署疾病管制局發現的AB菌。大陸天津、杭州的2條,韓國1條。

劉教授表示,大陸浙江抗州的AB菌與台灣的AB菌很類似,有可能兩岸交流中進入,值得重視。

台灣AB團隊去年10月中旬成功的7株台灣本土菌株解序,送入美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心。今年即全基因體排出,現TYTH-1成為全世界的代表菌株,101年9月17日將所排列出全基因體已上傳至美國國家資料庫,9月22日拿到美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心審核號碼,成為AB基因體為全世界的第11 條,亞洲地區的第5條。AB 基因體序列已於10月3日全球公開,論文也於10月4日獲得美國知名細菌學期刊接受刊登。

劉教授說,AB團隊值得一提人物即是國立清華大學資訊工程系博士生謝明峰利用電腦作大量序列資訊的拼組工作,雖然是盲生,但是他卻在電腦序列上非常強的協助。其次元培科大醫學檢驗生物技術系大學三年級張書聞、陳姵儒、邱培承基因序列印証。靜宜大學資訊工程系大學三年級沈義傑基因註解等都相當優異。

唐傳義校長表示,AB團隊未來願景即是一菌穿心萬菌齊發。

今天記者會有台大醫院副院長楊宏智、元培科大校長林志城、執行董事蔡賢、醫事科技學院院長劉中和、醫學檢驗生物技術系主任陳有任、中華大學副校長鄭芳炫等均共同參與。

訊息來源:元培科技大學

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