民主進步黨籍立法委員段宜康上午在立法院內政委員會質詢表示，總統馬英九日前在國慶談話中提及兩岸互設辦事機構是未來兩岸工作重點，這是政府機構還是兩會（海峽交流基金會和海峽兩岸關係協會）機構？
行政院大陸委員會主任委員王郁琦答詢說，目前規劃是兩會互設機構。日前由前海基會董事長江丙坤與海協會長陳雲林主持的制度化協商江陳會第8次會談中，雙方也彼此同意將這個議題帶回去研究。
王郁琦說，兩會互設辦事處的部分比較成熟，是否再往前，目前只能初步研究，難度比較高，主權問題一定是各自爭議，希望一步步研究。
王郁琦表示，在總統國慶講話前，陸委會的規劃都是朝兩岸兩會互設辦事處初步研究，總統希望儘速推動兩岸互設辦事機構，不管是兩會或者雙方政府互設機構，陸委會都會研究。
王郁琦說，兩岸關係本來就是動態變化，會持續研議，循序穩健推動。
施顏祥答復中國國民黨籍立法委員徐耀昌質詢時也表示，兩岸經貿機構互設辦事處在近期應該就會有結果出來，而經貿機構之外，更廣泛的兩岸互設辦事機構，「我們是大力支持」。
施顏祥說，兩岸互設辦事機構對台商在當地活動會有更大保障，並促進兩岸更正常交流、制度化機制。