吳欣修表示，小巨蛋興建經費廿一．六億元，台南大學須設法籌措十五億多元，另外，中央對台南大學校區計畫經費，由原七十五億縮減為六十億元，南大本身還要自籌建校經費十四．四億元，等於文化校區加小巨蛋興建計畫，南大要自扛卅億元，財源負擔可觀。
由於南大籌措財源能力，引起民代質疑，甚至批台南大學沒有興建能力，只是以小巨蛋計畫占著南台南站都計土地，以取得文化校區用地，要求市府下通牒限期，否則收回土地。
吳欣修表示，市長多次陪同南大向行政院、教育部爭取經費，今年四月也邀市府與南大協商，以盡力促成美事，畢竟南大已投入該計畫一段時間，目前仍等待南大能提出期程爭取中央核定及經費到位，尚未決定取回土地。