國務院：官員行程衝突才缺席
馬英九總統昨接受TVBS專訪時也澄清說，九二五護漁權及宣示主權是漁民自發性行動，非政府主導，且我方未挑釁或主動衝突，是非常和平理性的行動；美台國防工業會議的問題，與漁民的行動完全沒有關係。國防部副部長楊念祖在會後將轉赴華府，與原本要參加上述會議的美國官員「碰面」，台美高層官員的會面完全未受影響。
至於美方高層官員為何缺席，馬坦承，他也不是很清楚，但我方在事前就知道此事；四年多來，台美間重要的互信基礎就是「零意外與低調」，雙方若有大事，一定會事先打招呼。
美國國務院發言人室一日發出新聞稿說明，美台國防工業會議是一項私人的工業會議，而非官方活動。國務院與台灣當局在不同層面有頻繁的互動，「我們與台灣的溝通管道以及合作仍是顯著的，與美國長久的政策一致」。國務院的一位資深官員無法出席擔任主講人，是因行程衝突，但仍有幾位國務院的代表出席。
吳釗燮與會 稱確實與保釣有關
不便具名的官員說，國務院和國防部長期參與這項會議，未來會繼續參與。
但出席會議的民進黨政策會執行長吳釗燮表示，據他了解，美國兩位資深官員缺席確與台灣漁船赴釣魚台，且台、日船艦互射水柱有關。因為台灣的作為被視為挑戰美國在東亞利益，且與中國的行動前後呼應，讓美方質疑兩岸在釣魚台問題上聯手。會中也有多位美國學者及前官員向楊念祖發出質疑。
楊念祖表示，他是在臨行前被主辦單位告知美國資深官員不能出席，美國在台協會上週五也曾致電告知，並未提到和釣魚台事件有關。
針對與會人士關切台灣在釣魚台的作為，楊念祖說，他們主要是提醒台灣不要搞敵對 （antagonizing）。他回答說，台灣國防部及海巡署都是依國安會指示的既定任務作為，未逾越既有作為方式，也沒有破壞與日方的默契，台灣與北京也沒有任何協商互動。
他表示，將在訪問華府與美方資深官員會面後返台，雙方互動未受影響。據了解，楊念祖預定和國防部亞太副助理部長李波特會談。