繼日前推行國民教育引發北京對香港「洗腦」爭議後，香港船難發生後，由於大陸中聯辦副主任李剛與香港特首梁振英一同至醫院探視傷者，又主動要求廣東派船支援。引發香港民主派人士批評，中聯辦涉及干預香港內政。但也有香港市民認為，救人第一，無須泛政治化。香港不少媒體昨日皆以中聯辦「罕有」介入，來形容大陸中央駐香港聯絡辦公室，在這次船難中角色。香港一些民眾認為香港內部事務跟中聯辦和廣東省沒有關係。這次中聯辦主動積極的舉動，已凌駕特區政府之上，破壞一國兩制。