海峽交流基金會日前修訂組織章程，將董事長改為「有給職」，引來批評。海基會今天發布新聞稿表示，辜振甫擔任海基會董事長時，因海基會仍在初設階段，並非專職，也沒有薪資問題。
海基會指出，前董事長江丙坤上任後，兩岸恢復協商，而且兩會交流頻繁，海基會董事長責任艱鉅，需全心全力投入，已有專職之實。
海基會說，江丙坤雖認為任內不宜修訂海基會組織章程，但也指當前兩岸情勢有建立長久制度的必要，才於卸任前主動提出於董事會修訂組織章程。
新聞稿指出，目前政府捐助成立的財團法人，董事長如為專職，均為有給職。海基會組織章程修訂，尚需報經主管機關核定，未來董事長薪資將根據行政院訂定的「政府捐助之財團法人從業人員薪資處理原則」，由主管機關陸委會召集外部學者專家及會計師等審定。
新聞稿引述海基會董事長林中森的話表示，考量當前國內薪資情況及外界觀瞻，薪資不宜過高，「我是來為國家做事，對薪資不會計較。」
海基會說，董事長專職基於兩岸情勢及職責的需要，以建立制度為考量，未來由誰擔任董事長都適用，絕非量身訂做，因人設事；在江丙坤卸任前建立制度，更非自肥。