外交部長楊進添轉任總統府祕書長，職缺由駐歐盟代表林永樂接任；陸委會主委賴幸媛外派接任世貿組織（ＷＴＯ）大使，國安會諮詢委員王郁琦接掌陸委會；海基會董事長江丙坤請辭獲准，由國民黨祕書長林中森接任，遺缺由身兼國民黨副主席的總統府祕書長曾永權轉任。
此份政府高層人事改組名單，以頭號智囊金溥聰駐美、貼身幕僚王郁琦出掌陸委會最受矚目，在東亞局勢詭譎與中共十八大登場在即的關鍵時刻下，充滿展現馬英九強勢主導的決策意志，以及強化對美工作與緊抓兩岸路線的執政重點。
至於外界關注的財經部會人事，黨政高層表示，現今正值歐債關鍵時刻，且二月初改組已對財經部會進行調整，為維持國內財經穩健發展，基於穩定性與延續性考量，此時不適宜做調整。
黨政高層證實，府院黨及國安、外交及兩岸高層，將在九月下旬進行大規模連動調整。黨政高層表示，現任國安會祕書長胡為真、海基會董事長江丙坤，以及駐ＷＴＯ大使林義夫近月先後向總統表達退意，馬英九據此進行全盤思考，除延聘胡為真與江丙坤為總統府資政外，並從為政府注入活水的角度，進行人事大洗牌。
接任國安會祕書長的袁健生駐美四年多，不僅強化台美高層互信，更爭取美國政府部門多次公開表態支持台灣，贏得層峰肯定，被讚許為「做什麼像什麼」，因此委以國安會祕書長重任。
駐美代表一職，則由被視為「馬英九分身」的金溥聰接任。黨政高層透露，金溥聰原本希望在今年總統大選後淡出政治，但馬英九希望金溥聰繼續為執政團隊服務，因而決定由金溥聰出使華府，深化台美互信。
四年前金溥聰助馬英九贏得總統大位後，曾表示自己「不入府、不入閣」，僅擔任過黨職工作；連任後，以無給職的國民黨國際事務首席顧問赴美，形同為新職鋪路，這也是金溥聰首次接受政府職務。黨政高層表示，馬英九任命金溥聰駐美，顯示馬英九對台美關係的重視，金溥聰可望「精準傳達馬英九的政策理念」，而美方也對此表示肯定與歡迎。
江丙坤的請退則牽動海陸兩會佈局。被視為副總統吳敦義親信的林中森意外接任，但因他並無兩岸事務背景而引發關注。黨政高層表示，林中森出身基層，熟悉行政部門運作，調和鼎鼐的能力更受肯定；尤其林中森本土色彩濃厚，未來在海基會董事長一職代表台灣對外談判，將可充分顧及台灣民眾感受。
搭配年長且資歷完整的林中森，陸委會主委則由年僅四十三歲的王郁琦接任。黨政高層表示，王郁琦深受馬英九倚重，由其接掌陸委會，將可貫徹馬英九的兩岸政策理念；而其法學背景也將使兩岸關係進展由開拓經貿發展進入建立法律秩序的階段。
原任的賴幸媛則以其國際經貿背景，接任ＷＴＯ大使。黨政高層分析，ＷＴＯ是我國參與最全面的國際組織，賴幸媛將以四年來對大陸工作的成為為基礎，開拓我國在國際多邊經貿組織的參與。
在連動影響下，楊進添因老成持重、使命必達，以七十高齡接掌總統府祕書長；而今年才從立法院轉往總統府的曾永權，則轉任黨祕書長，肩負部署二○一四年七合一選戰的任務。