「自由時報」報導指出，交通部旗下的桃園機場公司、港務公司、中華郵政和台鐵編列最多5.74個月的年終獎金，其中虧損龐大的台鐵仍編列2.78個月的績效獎金，引發爭議。交通部長毛治國今天(16日)受訪時表示，台鐵虧損部分主要是退輔基金虧損和利息負擔，但是台鐵本業經營仍非常努力。毛治國說：『(原音)我要跟大家講，台鐵的虧損絕大部分都是退輔基金、過去利息負擔，這部分不可歸咎責任給他們，這背景很多人都知道，我是要強調一下，本業這幾年，他們非常努力。』