在禽流感防疫疏失糾正方面，提案監委程仁宏、錢林慧君、楊美鈴指出，今年國內陸續發生五起高病原性禽流感疫情，頻率比往年顯著提高，病毒指數增高、鹼性胺基酸漸趨雷同，顯見疫情有本土化趨勢，農委會卻輕忽怠慢防疫作為，延誤防疫先機；而高、低病原性禽流感的檢驗、判定屬於畜衛所權責，但許天來擔任防檢局長後，以「現場死亡率」作為臨床症狀判斷主要依據，農委會卻長期漠視禽流感病原判定機關權責紊亂，未予統合。至於，防檢局明知禽流感為高病原性卻通報世界動物衛生組織為低病原性，相關人員通報不實、隱匿疫情，都應議處。
南市防疫處3年前疏漏 也被糾正
另外，九十八年台南新市蛋雞場疑似傳出疫情後，因農委會副主委王政騰與業者係舊識，暗示部屬開脫；第一線的台南市動物防疫保護處沒有對飼主裁罰，並讓新市蛋雞場案是否曾發生高病原性禽流感真相未能釐清，形成疫情防治重大疏漏，確有疏失，因此一併糾正。
關於，工業用再生硫酸銅流入飼料工廠糾正案，提案監委之一的程仁宏說，去年十二月昶昕公司回收電路板、電子零組件廢液提煉工業用再生硫酸銅，販售給偉赫公司，偉赫公司卻將工業用再生硫酸銅出售給四家飼料業者作為飼料添加物。
依權責，環保署、工業局需查察業者是否將工業用硫酸銅作為飼料或有機肥料原料等用途，但昶昕公司的硫酸銅竟一路通過追蹤管制，成為畜牧飼料添加物，凸顯環保署、工業局管控出現漏洞，才會給予非法業者可乘之機，確有疏失。
農委會、環保署：會檢討改進
農委會則是在去年底事件爆發後不但沒有提出保護消費者安全配套措施，在今年三月媒體報導時，仍未能公開相關資訊，直到監院調查後，農委會才稱將檢討修正飼料管理法，公開不合格的業者及農戶名單，顯示農委會對於國人飲食安全態度消極。
對於一天被兩糾正，農委會回應表示，尊重監察院決定，將針對未盡周延處進行改進；台南市動物防疫保護處長李朝全說，對於新市蛋雞場疫情，該做的都有做，當時情況已呈報監察院判斷，會就糾正內容做適當處理；環保署長沈世宏也表示，會針對糾正內容檢討改進。