衛生署長邱文達今（3）日表示，二代健保確定於明年元旦實施，政府負擔的健保費用將提高，並增進對弱勢族群的保障，而民眾出國可以選擇繼續參加健保而不需要申請停保。而日前，中央健保局召開健保費協與監理2會聯席會議，提出「健保新制財務推估」報告，會中決議，一般保費費率第1年仍應維持現行5.17%，不可調降。聯席會議的結論將交由衛生署做政策參考，再送行政院最後拍板核定。
邱文達和副署長林奏延今天是在第5屆藥物經濟暨效果研究亞太會議(ISPOR) 上發表專題演講，對二代健保的醫療科技評估方式，與各國代表座談。
邱文達表示，台灣的健保制度現在面臨財務及人力短缺問題，將於明年推動二代健保，以維持5年財務平衡。在二代健保實施後，政府負擔的健保費用將提高，有效管理健保資源利用，同時增進對弱勢族群的保障。
例如二代健保上路後，全台49所矯正機關收容人將成為健保的保險對象，同享健保醫療權益，但基於公平原則，收容人必須繳交部份負擔。原則上收容人應優先於矯正機關內設置的門診就醫，如有轉診必要，再以戒護外醫方式至矯正機關以外之健保特約院所受治。
林奏延則提到，二代健保實施後，有關醫療科技的經濟與健康效益評估、訂價方式，應該納入公民參與，讓民眾在健保制度下，獲得新藥新科技所帶來的好處。
而8月31日召開的健保費協與監理2會聯席會議中，除決議一般保費費率第1年仍應維持現行5.17%外，另一決議則是「除薪資以外，包含兼職、高額獎金等收入應按2%費率繳補充保費」。未來包括利息所得、股利所得以及獎金等6大項目，單筆收入只要超過2千元就需要加收2%補充保費。據估計，約有2成共460萬人將被課徵補充保費。
由於衛生署之前曾多次宣示，在徵收補充保費後，一般保費費率可以從現行5.17%往下調降至4.91%，因此聯席會議的結論恐引起外界反彈。據聯席會議主席劉見祥解釋，原本被視為健保「救命活水」的補充保費，在景氣不佳的影響下，恐怕徵收金額會遠低於預期。健保依法需要有至少1個月的安全準備金，若不維持現行費率5.17%，恐怕難以維持健保財務。