高雄市府在30舉行記者會表示，縣市合併後，中央對高雄市的補助年年減少，兩年來短差近300億，陳菊表示，縣市合併前，中央政府屢屢對外承諾，合併之後對高雄的補助「只會多、不會少」，事實是合併之後一年比一年少。中央補助地方政府財源，主要包括統籌分配稅款、一般性補助款，以及計畫型補助款，以縣市合併第一年100年為比較基準，101年的補助少了127億，102年更少了166億，缺口年年擴大，兩年加起來，中央虧欠高雄人將近300億的建設經費。
市府財政局長李瑞倉表示，縣市合併過程太過倉促，相關配套措施未及上路，致使地方政府欠缺財源，雖然中央統籌分配款微幅增加，但兩年來一般性補助款卻大幅減少約188億，加之各項建設的經費補助比例也縮水，使地方財政雪上加霜。中央一再對外放話「補助只多不少」，實際補助卻「明升暗降」，讓地方背負「亂花錢」、「不知開源節流」的罪名，非常不公平。
市府指出，相對於過去對高雄縣的補助，縣市合併後許多中央經費補助比例反而下降，包括：生活圈道路系統計畫補助由88%降到73%；污水下水道工程由98%降到88%；鐵路立體化計畫由90%降到78%，顯見高雄市合併後經費補助不但沒有升格，實質上反而遭到降格。
另外，高雄的「易淹水地區水患治理計畫」用地補助，從70%降到60%；原中央核定之高雄治水計畫總經費達384億元，但目前中央僅補助91億，尚有293億的缺口未有財源支應，讓地方政府預算編列捉襟見肘。
另一方面，中央政府長期重北輕南，高雄的國公營企業污染留給高雄，每年上繳中央的營業稅數百億、盈利上千億，但高雄分得的統籌分配款卻比台北少了102億。縣市合併之後，不公平的情況更是變本加厲，以勞健保欠費補助款來說，高雄人口277萬人，比台北266萬人口多了11萬，但近三年中央的勞健保欠費補助，高雄僅有22億多，台北卻獲173億多，是高雄的7.7倍，兩者相差高達150億。
陳菊認為，合併升格應該是歡欣鼓舞的喜事，而非懲罰高雄，在五都之中，高雄市是唯一一個合併前縣市補助比例落差懸殊的城市，情況特殊，中央對原高縣建設經費的補助比例不應在合併後馬上收手，應維持一段期間，補足地方建設經費缺口。並且北、高兩市獲分的統籌分配款、勞健保欠費補助款等金額天差地遠，更凸顯中央重北輕南的情況變本加厲。市長陳菊在記者會強烈呼籲中央給予高雄市民應得的財政正義，並儘速落實「財政收支劃分法」與「公債法」修法，把缺口補上，讓高雄的建設資源不再匱乏。
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