特偵組發言人陳宏達說，依照法院組織法第六十三條之一規定，特偵組職掌範圍包括部長層級以上的貪瀆案件，雖然吳敦義和劉憶如當時分別為行政院長及經建會主委，但蔡英文提告案件是正副總統選罷法，並非屬於特偵組偵辦案件。
此外，由於蔡英文和律師黃帝穎分別在去年十二月和今年五月，向北檢控告吳敦義和劉憶如，北檢調查後，因查無不法而陸續簽結；基於檢方併案規則，特偵組承辦檢察官經報請檢察總長核可後，決定發交由北檢偵辦。
陳其邁引法院組織法指出，除部會首長或上將以上之人員所涉貪瀆案件外，選務機關、政黨或候選人涉及全國性舞弊、妨害選舉之案件，特殊重大貪瀆、經濟犯罪、危害社會秩序，經檢察總長指定之案件，都可由特偵組偵辦。特偵組當年辦了江國慶案，難道這也是貪瀆案件？
他質疑，是否因檢察總長黃世銘是馬英九所提名，牽涉到馬英九的案件，特偵組就要畫地自限、自我繳械？這算啥司法鐵漢？
他指出，宇昌案是選前最重大的變數，還由特偵組大動作偵辦、簽結，最後總算還給蔡英文一個清白，難道這不算全國性的舞弊、妨害選舉案件？
陳其邁說，民進黨在選前就國民黨陣營在宇昌案中的抹黑提告八次，皆由北檢檢察官張書華偵辦，卻連一次傳訊都沒有，就草率簽結；這位檢察官還將在九月升任嘉義地檢署主任檢察官，早引法界疑竇。他們因此才向特偵組提告，結果特偵組又發交北檢，等於是「請鬼抓藥單」，真相恐無大白之日。