馬英九總統獲致消息後，立即親電致哀，對單國璽的逝世表示不捨與哀痛。高雄市長陳菊也表示，台灣失去一個穩定社會重要力量，但單樞機主教的精神將影響深遠，長存人間。教廷司令爵士、前立委李復興則哽咽地說，要與教友們完成他未完成的真福山養老院、育幼院心願。
院方在昨晚以電話聯繫單國璽住在大陸河南的妹妹單愛雲，雙方進行兩、三分鐘簡單通話，了卻他未能會見妹妹的遺憾。天主教主教團也與海基會聯繫，盼基於人道立場，讓他的妹妹來台奔喪。
洪山川說，今天上午全台教堂的第一場彌撒就是為單國璽追思，教友間的彌撒則於上午十點於北市新生南路聖家堂進行。靈堂則設置在台北市樂利路九十四號的台北總主教公署，預計下午開放民眾追思。單國璽於死前錄製了一段話，將於公開追思會時播放。
洪山川說，大體暫時留置耕莘醫院，但由於單國璽是高雄教區的主教，待彌撒結束，會依照他的遺願，將他的遺體移至高雄，屆時可能安葬在彰化靜山耶穌會的墳地。
洪山川感嘆，他廿日（周一）至新店耕莘醫院進行割膽手術，單國璽則因呼吸困難進院治療，兩人同一天住院，廿一日單國璽坐在輪椅上至病房探視，還囑咐他要好好照顧身體，豈料隔日就與這位老朋友天人永隔。
新店耕莘醫院指出，他在生前要求不要進行侵入性治療，院方僅給予氧氣、利尿劑，因單國璽口腔已糜爛，只能進行流質營養補充。
單國璽於民國九十五年八月，在新店耕莘醫院被診斷出罹患肺腺癌第四期，因肺部腫瘤離大動脈太近，醫生認為開刀有風險，化療藥物副作用強，最後建議嘗試標靶藥物治療。
單國璽七月再度因為肺部感染至耕莘治療，直至七月廿日出院，當時他告知院方，他感覺距離天國的日子近了，要做自己想做得事，廿日以後便不肯再回到醫院治療。
新店耕莘醫院院長鄧世雄說，單國璽出院當時精神狀況還不錯，接連兩天上午都進行彌撒，甚至會客，剛開始還會比手勢，後來僅能用表情、點頭來示意，他還想下床寫點東西，但一下床就出現缺氧現象，被醫護人員立即扶回床上。