外傳陳庚金因在選舉中未支持黨提名立委候選人江啟臣，造成地方極大反彈而未獲續聘。林淵源則是在總統大選支持親民黨主席宋楚瑜而未上榜。
同是黑派大老的前立委陳傑儒表示，雖然豐原選區黑派有議員車淑娟投入選舉，但總部主委是他掛名，陳庚金未站到第一線，這已很給國民黨面子了。他並強調，在其他選區還是支持國民黨的候選人，尤其總統的部分更是一致支持馬英九。
強調事前沒有任何溝通或告知的陳庚金表示，雖然選前他對馬英九的用人等意見很多，但最後關頭還是擔任策略指導委員會總召集人，並公開站台挺馬。他認為，自己是「黨國重臣」才獲聘資政，國家名器不該拿來秋後算帳之用。
陳庚金表示，政治很現實，或許認為他已經沒有利用價值，所以做得這麼絕。他說，「馬英九缺乏政治氣度，小鼻子小眼睛，民調才會這麼低。」是否他已沒有利用價值？他說，馬英九不需要他，國民黨是不是不需要他？來日方長，「大家相堵會到！」
至於身為白派大老的林淵源的去留，難免牽動「馬王關係」。據了解，府方事前雖然並未告知立法院長王金平此一決定，但曾徵詢並邀請王金平推薦國策顧問人選；世界台灣商會聯合總會總會長黃正勝與曾任中華民國工業區廠商聯合總會總會長蔡圖晉都因此入圍。
體育界代表方面，府方考量延攬不同領域及世代背景人士，因此紀政和賴復寰未獲續聘。
上屆的藝文界代表孫翠鳳是主動表示希望延攬不同領域的藝文界代表而讓賢。黃碧端和蔡清彥分別獲聘為兩廳院藝術總監及工研院董事長，因而讓出國策顧問職位。