天主教樞機主教單國璽於22日晚間6點42分，病逝於新店耕莘醫院安寧病房，享壽90歲。總統馬英九得知單國璽過世消息，深感不捨與哀痛，於晚間7時25分親自致電總主教洪山川，表示沉痛哀悼，強調單國璽不僅是一位宗教領袖，更是全民的典範。
新店耕莘醫院鄧世雄院長（左）與副院長林恆毅晚間連袂召開記者會，針對病情與治療過程提出說明。（攝影／張世傑）
晚間9時，新店耕莘醫院院長鄧世雄與副院長林恆毅連袂召開記者會，針對病情與治療過程提出說明。鄧世雄院長表示，單國璽在臨終之前，並沒有受到痛苦，覺得心滿意足，還降福給病榻旁的眾人，且在大陸高齡88歲的妹妹也打電話到病榻上，讓單國璽走得十分安詳。
鄧世雄院長強調，6年前單國璽得到肺腺癌，雖然病情一度受到控制，卻在今年5月癌細胞轉移到腦部和骨骼；這6年來，樞機主教單國璽雖然忍受標靶治療的痛苦，例如：拉肚子、嘴巴黏膜潰瘍、以及頭皮潰瘍等，但他都很欣然接受、勇敢面對，堪稱是每一個癌症病患學習的對象。
單國璽醫療團隊計畫主持人、耕莘醫院副院長林恆毅則表示，單國璽是在2006年7月在耕莘醫院診斷出罹患肺腺癌第4期，並開始接受化療、標靶藥物治療，原本醫師預測只剩下3、4個月到半年的生命，但單國璽以正面心態對抗病魔，2007年並開始巡迴各地演講。並經常引用馬英九總統的話「關關難闖關關過」自勉，但他也強調「老兵到最後還是要躺下的…」。
事實上，單國璽因罹患肺癌，肺功能本來就不佳，20日因肺炎再度住院，曾表示不願接受氣切等重症急救，詎料，晚間病情卻急轉直下，呈現昏迷狀態，院方依照病患要求，採取支持性的保守治療，直到嚥下最後一口氣前，單國璽都沒有受到痛苦。
依據單國璽的遺囑，喪禮將由天主教台灣主教團處理，由主教團進行彌撒儀式，但目前尚未安排後續的追思悼念儀式。