監察院調查發現，方自仁多次逾假歸營、不假離營，而且違反艦長、副艦長不得同時離艦的規定，擅自離艦，並經國防部高等軍事法院高雄分院判刑確定，嚴重影響國軍形象，有違失，依法彈劾，移送公務員懲戒委員會。
海軍官員下午受訪時表示，尊重監察院決議，方自仁事發後已遭調職，目前職稱是艦隊指揮部作戰中心主任，屬幕僚職。
有監委指方自仁遭軍法判刑，卻未調整職務；海軍官員解釋，當時已針對當事人違失部分處以職務調整，方自仁在目前職務上未有任何不稱職表現。
軍方人士指出，方自仁遭軍法判緩刑，依規定是可以繼續職務，所屬單位未來會依照公懲會決議再行處置。