有報載指出，經過媒體與民眾實際檢測，發現台鐵與高鐵共6種列車，在加速時被測到電磁波超標，宛如坐在變電所。
台鐵機務處指出，台鐵各型列車約1700輛，多數電磁波檢測符合規定，只有344輛EMU500型自強號及30輛EMU1200型自強號的地板，在車輛加速瞬間，電磁波超過環保署規範的833毫高斯；但座位以上的電磁波，全部都在安全值範圍。
台鐵已請廠商針對EMU500型及EMU1200型自強號的地板增加隔離層，排除車輛加速時產生瞬間超標的電磁波。
台鐵說，電磁波的測量受環境影響很大，如果民眾自行在搭車時測試，周遭電腦、行動電話產生的電磁波，都會影響實際的檢測值；而電磁波對人體的影響，醫學至今沒有定論。