財團法人國家實驗研究院台灣海洋科技研究中心表示，由於台灣現有的一、二、三號研究船，除船齡老舊外，噸位數過小，無法在東北季風期間出港作業，加上海洋資源研究愈來愈重要，因此於民國95年編列預算，97年與中信造船公司簽約建造。
國研院海洋中心表示，海研五號續航力長達50天，約可連續航行1萬3000多海里。同時，船長72公尺、船型設計抗浪性佳，可提升東北季風期間的作業能力，補足目前欠缺的冬季水文資料。
國研院海洋中心指出，海研五號配備多項先進科儀設備，如多音束聲納系統及多頻道震測系統，可大範圍精密測繪海床地形、地貌及解析地層構造，做為藍色國土調查的基礎。
另外，海研五號的重點任務，在支援新能源的探勘。國研院海洋中心表示，台灣西南海域發現有大量甲烷水合物賦存的徵兆，未來可藉由海研五號配置的3000公尺遙控無人載具(ROV)進行海床觀測，選定最具潛力的場址後，再以配置可採取海床下20公尺樣本的長岩心採樣器直接鑽取岩心深入了解。
海研五號將由國研院海洋中心負責管理營運，以高雄市興達港為作業母港，配備18名船員及30名研究員，預計每年可提供250天作業船期，除供國科會及國內大學海洋研究使用外，也將提供國內如中油、台電等企業使用。