以下為防治方法：
一、清除病媒蚊孳生源，預防登革熱
目前為登革熱流行季節，大雨過後病媒蚊密度將大增，民眾整理家園時，應澈底清除室內外積水容器、垃圾及廢物，以防止病媒蚊孳生而導致疫情發生。
二、清理家園時切忌赤足及穿著拖鞋打掃，避免鉤端螺旋體及類鼻疽傳染病感染
民眾清理家園時務必穿著雨鞋或防水長靴、配戴防水手套及口罩做好個人防護措施，工作完畢應以肥皂及清水洗手。如有出現發燒、頭痛、肌肉痛、腹痛、腹瀉、黃疸、倦怠或其他身體不適的症狀請儘快就醫，水災期間易接觸到污水、污泥，可能因此感染鉤端螺旋體病、類鼻疽及其他皮膚病。就醫時務必告訴醫師接觸史以利醫師診治。
三、注意飲水、食物及環境衛生，預防腸道傳染病
豪雨可能導致飲用水受到汙染，若住宅的蓄水池淹水應確實清洗消毒後再蓄水；飲用水要徹底煮沸或飲用包裝水；泡水用具消毒後才能使用，泡過水或解凍過久的食物也不要食用；民眾可購買市售含氯漂白水並稀釋100倍擦拭居家環境，而餐具部分應煮沸消毒，不能煮沸者用清水10公升加40毫升漂白水稀釋消毒，民眾務必依「清除、清潔、消毒」防疫三步驟做好環境衛生。民眾若有災後防疫相關疑問亦可聯絡衛生局所，或撥打國內免費民眾疫情通報與關懷專線1922洽詢。