馬國鳳研究團隊在九二一大地震後，即在車籠埔斷層帶設置跨過斷層的七層垂直井下地震儀陣列，希望透過這個世界上最接近活動斷層帶的監測儀器，「去發現別人看不到的現象」；並鎖定芮氏規模接近零的「微小地震」做研究，一年之內蒐集到卅幾筆資料，首度以數據證實科學界傳聞已久、關於水壓與地震關聯性的假設。
馬國鳳表示，地震通常是兩個斷層面相互摩擦造成，但是研究團隊卻發現微小地震只有Ｐ波、沒有Ｓ波的特殊現象，意味有些地震並非是經由摩擦造成的震動，而是直接把岩層撐開的爆炸力量。馬國鳳解釋，當水流動受阻、積壓在同一個地方過多後，水壓大於地底的承受力時，就會讓地層裂開，進而誘發小地震，「地震的發生與水的流動有關」，是全世界第一次找到準確而直接的證據。
馬國鳳並表示，當前為解決全球暖化溫室氣體問題，興起二氧化碳封存技術，就是把空氣中太多的二氧化碳注入地底下，但卻一直欠缺安全風險評估。未來，二氧化碳灌入地下，透過井下地震儀的偵測，將可了解其活動情形，正確評估二氣化碳封存的風險，體認其環境影響。
此計畫為台灣自行主導及執行的計畫，能獲科學期刊的登載，表示國內研究能量受到國際重視，並能主導前端性的科學議題及研究。