陳正倉、鍾起惠、翁曉玲三人都曾被旺中集團點名批判，憤而退出旺中案審查。陳正倉強調，ＮＣＣ是獨立機關，委員應具備能力、操守、公正和抗壓性，「人要對，做的事才會對，人不對，只會聽命上面、壓力來時失去判斷。」
翁曉玲指，ＮＣＣ獨立性的淪喪可從預算及決定兩方面來看。預算不足要經立法院審查；作成的處分若業者不服，竟是送行政院訴願，且行政院可直接撤銷。再者，第四屆主委改由行政院指派，跟「交通部長」沒兩樣！
鍾起惠也感嘆改行首長制，意味ＮＣＣ的獨立精神已死！因為主委握有行政資源，任期最後仍有近五十個待清倉議案，為何先排這幾案？權限就在主委。鍾起惠直言，其他四委員倉卒妥協通過旺中等備受爭議大案，如今「吞不下去，也吐不出來」，對ＮＣＣ威信是一傷害。