其中嘉義地檢署負責偵辦官員疑涉收賄的部分；高雄地檢署則偵辦勞務採購官商勾結部分。
嘉義、高雄地檢署共動員台中市調處、北機站、中機站等單位，搜索地點包括嘉義縣政府縣長室、經濟發展處、環保局等單位，帶走部分電腦主機、電腦硬碟與開發計畫文件、存褶等。嘉檢動員150人搜索、約談；雄檢動員250人。
包括陳明文、張花冠、嘉縣府秘書長吳容輝、機要秘書陳川崎、地政處長徐寶璋、環保局長沈弘文、經發處長張志銘、前城鄉處長劉培東等人，分別到台中市調處、高雄市調處及南投縣調站說明。嘉義地檢署3名檢察官直接在台中複訊相關被告。
高雄地檢署與嘉義地檢署表示，案件雖都是衍生自香草藥草園區開發案，但實為兩個獨立案件。不過由於兩案偵查與搜索都涉及嘉義縣政府，為避免同一地點被搜索兩次，引發外界疑慮，兩地檢署月前開會協調，敲定同日搜索，但辦案標的並不相同。
嘉義地檢署表示，嘉義縣政府在民國96年間辦理「嘉義香草藥草生物科技園區促進民間參與投資案」，採BOT（Build Operate Transfer）方式，由政府將土地設定地上權後，出租給民間業者從事開發及營運，經特定時間後，再移交給政府。投標廠商為了順利取得標案，疑似行賄相關首長與公務人員。
經檢調專案小組全面清查相關當事人的帳戶資料，發現廠商的賄款分別經由當事人、當事人子女或第三人的帳戶提示兌現，另有部分行賄款項，是否透過其它方式交付，目前正由檢方查證中。
至於香草藥草園區（現為大埔美精密機械園區）開發衍生勞務採購官商勾結案，高雄地檢署查出，疑有廠商行賄嘉義縣政府與高雄市政府公務人員後，發生洩漏預算金額及評選委員名單等。
高雄檢方監控涉案廠商行蹤另發現，高雄市政府水利局廖姓科長於辦理採購案件時，涉嫌接受廠商招待赴有女陪侍的酒店飲宴後，洩漏水利局辦理勞務採購案件評選委員建議名單，讓廠商依名單行賄各大學教授。