目前台北捷運站內的悠遊卡加值硬體設備皆由國泰世華銀行提供，並比照銀行提款業務，當持卡人以國泰世華以外的金融卡加值時，須另外負擔5元手續費。不過因銀行公會認為，該服務屬轉帳業務，主張進行跨行轉帳的持卡人應負擔15元手續費，並做成決議，要求各銀行遵守規範。
悠遊卡公司則表示，各銀行為配合銀行公會決議，原本一度決定全面取消悠遊卡自動加值機金融卡加值服務。但基於國泰世華為台北捷運公司金融服務合作銀行，同時是負責介接捷運車站悠遊卡自動加值機系統的金融機構，加上持國泰世華金融卡加值並無「跨行」問題，經爭取後，國泰世華允諾將繼續提供金融卡自動加值機加值服務。
事實上，悠遊卡公司也透露，利用金融卡加值悠遊卡儲值金的使用比例原本就不高，整體使用量平均僅1.1%，多數採現金加值居多，因此取消跨行服務對持卡人影響並不大，且若是改成跨行轉帳不但要修改系統設備，也有銀行間手續費拆帳等問題，因此最後才會取消金融卡加值服務。