經過八場密集產官學界會議後，四月十二日，財政部在府院皆要求「盡快定案，以降低市場不確定性」的前提下，晚間七點鐘召開記者會，提出證所稅財政部版本。提出前，由行政院陳冲院長主持，在院長室召開會議通過；提出後，各界原本反應良好，第二天台股上漲一二五點，成交量近一千億。散戶代表阿土伯當晚在電視節目中說，「對財政部證所稅版本，雖不滿意，但可接受」，他還甚至在節目中，公開為財政部的努力拍拍手。另外，總統府和行政院也都對這結果滿意，大家都暫時鬆了一口氣。
但是，後來的情況卻有了很大的變化。自財政部四月十二日提出證所稅版本，至四月廿六日間，行政院的審查會，進行的非常不順利。經過種種波折，協商與讓步，包括免稅額度由三百萬提高至四百萬元，還有對繳證所稅的人，他們已經繳納的證交稅可以折半扣抵等等，終於協商出一個「行政院版」的證所稅，這也是目前在立法院，等待審查表決的五個證所稅版本之一。
在等待行政院院會終於通過的這兩個星期間，各種反對力量傾巢而出，原本支持的聲音也愈來愈小，到了四月廿六日，甚至有人說「國民黨沒有一個立委支持證所稅的」。這不是事實，但，如同其他各種不實的傳聞，真相，又一次被掩蓋；原因，則可能錯綜複雜吧。